хочу обмениваться ссылками , но не хочу захломлять место на страницах своего сайта. у меня есть раздел "каталог сайтов" , можно ли при обмене добавлять ссылки партнерских сайтов в каталог, а не на сами страницы сайта? Критично ли это?

Каталоги ссылок доступные поисковым роботам для индексации на "рабочих" или основных сайтах категорически неприемлимы. Т.к. они напрямую нарушабт правила присутствия в индексе Вашего сайта в большинстве поисковых систем. Если подобный нетематичический (иногда и тематический) каталог найдут конкуренты они скорее всего на Вас напишут абузу и Ваш сайт благополучно попадет в бан.

Поэтому остается только регистрация в белых катлогах и покупка ссылок на биржах купли-продажи ссылок, как пример SAPE

вопрос немного не в этом заключался, а в том, можно ли пи обмене ссылками ссылку размещать не на главной странице или на основых страницах сайта , а в специально отведелнное место - каталог сайтов?

Так в принципе возможно обмениваться ссылками (с другими сайтами, если те, с кем обмениваться согласны с этим), но при использовании бирж купли-продажи ссылок, так делать нельзя...

Да, при обмене желательно делать отдельный каталог сайтов, а не размещать ссылки на главных или внутренних страницах. Но учтите, что каталог может стать поводом для бана, если конкурентов и недоброжелателей много.