Как следует из названия, этот скрипт проверяет файлы на изменения внесенные третьими лицами, а так же обнаруживает новые файлы закаченные без ведома владельца сервера. В случае если файл был изменен или закачен, система примет адекватные действия - отправит электронное письмо владельцу сервера и переименует подозрительный файл, так, что бы взломщики не могли его запустить и использовать для свох целей. Тема очень актуальна в наша время, около 90% взломов сопровождаются закачиванием шеллов либо затрояниванием уже существующих файлов. На самом деле в открытую ломают очень мало ресурсов, абсолютное большинство остается незамеченным ибо на них закачивают шеллы и используют своих целей (спам, дорвеи - список можно продолжать на сколько позволит фантазия). Integrity Checker позволяет пресечь все это дело.

Подробный мануал на русском:
http://anopov.com/files/IC_RUS.pdf

Ссылка на последнюю версию выкладывается здесь:
http://anopov.com/ic

Ссылка не работает. Где можно скачать данную программу и инструкцию к нему7

Где-то видел плагин к wordpress с подобными функциями, а этот проект я смотрел на этапе публикации этой темы - код был закрыт зендом, следовательно использовать этот скрипт для серьезных проектов небезопасно...

Да и написать что-то подобное с нуля, от силы займет 1-2 дня...