$text = file_get_contents('somepage.html');
$pattern = "#<(h1|h2|h3|b|em|strong|i)[^>]*>([^<]+)<\/\\1>#is";
preg_match_all( $pattern, $text, $matches );
$keywords = array();
$stop = array('как', 'над', 'под', 'или', 'при');
foreach( $matches[2] as $string ) {
    $string = strtolower( $string );
    // разбираем строку, заключенную в теги <em>...</em> на отдельные слова
    $words = preg_split("#[\s.,;!?]+#", $string);
    foreach( $words as $word ) {
        // если слово слишком короткое - пропускаем его
        if ( strlen($word) < 3 ) continue;
        // всякие предлоги
        if ( in_array( $word, $stop ) ) continue;
        // если этого слова еще нет в массиве ключевых слов
        if ( !in_array( $word, $keywords ) ) {
            $keywords[] = $word;
            echo $word.'<br/>';
        }
    }
}
echo 'Total: '.count($keywords);